Beruflicher Werdegang

2015 - aktuellDeutsches Forschungszentrum für Künstliche Intelligenz (DFKI), Berlin
Projektleiter und Forscher mit dem Schwerpunkt medizinische Textverarbeitung und klinische Entscheidungsunterstützung; Projekte: smartNTX, PRIMA-AI, KIBATIN, ADBoard, KEEPHA (Knowledge-Enhanced information Extraction across languages for PHArmacovigilance), vALID (Klinische Entscheidungsfindung durch Künstliche Intelligenz: Ethische, rechtliche und gesellschaftliche Herausforderungen), Big Data for Medical Analytics (BigMedilytics), Medical Allround-Care Service Solution (MACSS)
2012 - 2015Universität Sheffield, England
Promotionsstudent in der Forschungsgruppe für natürliche Sprachverarbeitung (NLP). Schwerpunkt auf selbstüberwachte Relationsextraktion mit UMLS
2011NTT Communication Science Laboratories, Kyoto/Japan
Forschungspraktikant im Labor für digitale Signalverarbeitung
2008 - 2011Deutsches Forschungszentrum für Künstliche Intelligenz (DFKI), Berlin
Softwareingenieur, Arbeit an folgenden Projekten: SpeechEval, SmartSenior sowie DiaSim
2006 - 2008Comlet Verteilte Systeme GmbH, Zweibrücken/Deutschland
Softwareingenieur im Bereich eingebettete (automotive) Systeme

Weitere Arbeitserfahrungen

seit 2018Charité - Universitätsmedizin Berlin
Gastwissenschaftler mit Fokus auf Informationsextraktion aus klinischen Texten und Risiko-Vorhersagemodellen
2023Nara Institute of Science and Technology (NAIST), Nara/Japan
Gastwissenschaftler (2 Wochen)
2021-2022FOM – Hochschule für Oekonomie und Management
freiberufliche Dozententätigkeit
2022Universität Paris-Saclay/LISN, Paris/Franreich
Gastwissenschaftler (6 Wochen)
2015Universität des Baskenlandes/IXA, San Sebastian/Spanien
Gastwissenschaftler (4 Wochen)
2011NTT Communication Science Laboratories, Kyoto/Japan
Forschungspraktikant im Labor für digitale Signalverarbeitung (6 Monate)
2005 - 2006IWI - Institut für Wirtschaftsinformatik, Saarbrücken/Deutschland
Studentische Hilfskraft im Bereich Softwareentwicklung, Schwerpunkt eLearning
2004 - 2005CLT - Sprachtechnologie GmbH, Saarbrücken/Deutschland
Studentische Hilfskraft im Bereich Softwareentwicklung, Schwerpunkt Sprachdialogsysteme
2003Laboroxx GmbH, Trier/Deutschland
Forschungspraktikum im Bereich Webanwendungen

Lehrtätigkeit

-Seminar für NLP4Health - Natural Language Processing for Healthcare (hands-on) an der TU Berlin (2023)
-Vorlesung für Künstliche Intelligenz an der FOM (2022 und 2021)
-Seminar für Natural Language Processing an der TU Berlin (2021, 2019 und 2018)
-Demonstrator für Devices and Networks an der University of Sheffield (2014, 2013 und 2012)
-Demonstrator für Automata, Logic and Computation an der University of Sheffield (2014 und 2013)
-Demonstrator für Foundations of Computer Science an der University of Sheffield (2012)

Betreuung von Abschlussarbeiten

(in Bearbeitung) Doktorarbeit von Mirco Giannini "Erstellung eines Chatbots für die ambulante Versorgung von PatientInnen nach Nieren- und / oder Pankreastransplantation am Beispiel von Infektionen - eine methodische Etablierung"
(in Bearbeitung) Doktorarbeit von Margarita Rytvina "Optimierung und erste Evaluierung eines KI-Modells zur Prädiktion von Harnwegsinfekten bei erwachsenen PatientInnen nach Nieren- und / oder Pankreastransplantation"
2024Masterarbeit von Jasper Spierling "Enhancing the Information Extraction from Clinical Trials with Large Language Models"
2023PhD Thesis of Lisa Raithel "Cross-lingual Information Extraction for the Assessment and Prevention of Adverse Drug Reactions"
2023Bachelorarbeit von Tim Pegler "Limitierte Trainingsdaten für die automatisierte Vorhersage des Performance Status von Tumorpatienten"
2023Masterarbeit von Ibrahim Baroud "Dealing with Offensive Language for Automatic Joke Generation"
2023Bachelorarbeit von Mohammed Hasan Hamed Bin Sumait "Negation detection in German using machine translation"
2023Bachelorarbeit von Abdelkader Alkadour "Unsupervised Cross-Lingual Trend Analysis in Online-News"
2022Bachelorarbeit von Iyadh Ben Cheikh Larbi "Systematic Effects of Text Anonymization Methods on State-of-the-Art Machine Learning Models"
2021Masterarbeit von Elif Kara "Correlations between depression and pronoun use: A collostructional case study on the copula construction"
2021Bachelorarbeit von Gerhard Hass "Extraktion von Medikamentennebenwirkungen aus Texten: Ein Ansatz mit Distant Supervised Learning"
2020Masterarbeit von Necip Oguz Serbetci "Self-supervised pre-training for learning distributed representations for electronic health records"
2020Masterarbeit von Priya Sivasubramanian "Clustering as a means to support decision making in artificial intelligence - Medical use case: Sepsis Prediction"
2019Masterarbeit von Gaurav Vashisth "Exploring Diachronic Changes of Biomedical Knowledge"
2019Masterarbeit von Oliver Marten "Nonfaktizität in deutschen, klinischen Texten"
2019Diplomarbeit von Arne Binder "Training recursive compositional models with hierarchical linguistic information for semantic tasks in NLP"
2018Masterarbeit von Laura Seiffe "Linguistic Modeling for Text Analytic Tasks for German Clinical Texts"

Sonstiges

- Organization des Kolloquiums in der DFKI Speech and Language Technology Gruppe von 2020 bis 2023.
- In der Vergangenheit habe ich Reviews für ARR (2022), EMNLP (2023, 2022, 2021), ACL (2023, 2022, 2021), Coling (2022, 2020, 2018), AIME (2022), AMIA (2021, 2020), EACL (2017), IWCS (2019), BioNLP (2022, 2021, 2020, 2019), Qurator (2021), Methods of Information in Medicine (2021) gemacht.
- Mitorganization verschiedener Shared Tasks:
   * MedNLP-SC bei NTCIR-17 in 2023
   * Biomedical Translation Shared Task bei WMT in 2023, 2022, 2021, 2020 und 2017
   * SpRadIE - Information Extraction from Spanish radiology reports, bei CLEF eHealth 2021